In der Kirche befindet sich eine Orgel vom Prager Orgelbauer Andreas Wambesser (1763). Es gilt heute als das einzige erhaltene Instrument von ihm. Im Jahr 2000 wurde die Orgel restauriert. Durch eine sensible Stimmung der Pfeifen gelang es, den unverwechselbaren Klang des Instruments noch einmal hervorzuheben. Früher hatten unter anderem Joseph Haydn und Wolfgang Amadeus Mozart die Möglichkeit, bei ihren Aufenthalten in Prag auf der Orgel zu spielen. Daran erinnert eine Gedenktafel in der Kirche.