La conception du club suit trois idées principales : premièrement, de présenter les meilleurs musiciens de jazz tchèque (Jiri Stivin, Emil Viklický, Lubos Andrst etc.), deuxièmement, d’introduire des musiciens de jazz ayant commencé leur carrière au centre de jazz Agharta et qui sont devenus célèbres (Roman Pokorny, David Doruzka, Robert Balzar, Yvonne Sanchez, entre autres), et finalement, de soutenir de jeunes musiciens talentueux en leur fournissant une scène pour leurs représentations.
En dehors de son programme régulier, le Centre de jazz organise chaque année le Agharta Prague festival de jazz mettant en vedette des artistes reconnus, tels que The Brecker Brothers, Chick Corea, Candy Dulfer, Jan Garbarek, Diana Krall, Branford Marsalis, Wynton Marsalis, John McLaughlin, Pat Metheny, Oregon, Maceo Parker, Courtney Pine, John Scofield, Wayne Shorter, Spyro Gyra, McCoy Tyner, Miroslav Vitous, Mark Whitfield, Yellow Jackets.